Представлены данные о полиморфизме межмикросателлитных последовательностей ДНК серебряного карася Carassius auratus gibelio в водоёмах юга Западной Сибири. Доля полиморфных ISSR-PCR-бэндов в популяциях карася из разных озёр варьировала в пределах от 40 до 70%, показатель генного разнообразия Нея – от 0.16 до 0.25. В популяциях, представленных преимущественно самками, показатели генетического разнообразия были меньше по сравнению с обоеполыми популяциями. Наибольшие показатели полиморфизма выявлены в популяциях, состоящих из диплоидно-триплоидных комплексов.